الأمراض دون تشخيص: المفتاح هو التسلسل الجيني وتفسيره

بالنسبة للأمراض المزمنة دون تشخيص ، فإن إجراء التسلسل الجيني داخل شبكة طبية مخصصة يتيح التشخيص في 35 ٪ من الحالات. ولكن من الممكن أن تذهب أبعد من ذلك.

لا يزال تشخيص العديد من الأشخاص المصابين بأمراض مزمنة نادرة أو غير معروفة على الرغم من الاستكشافات الطبية الشاملة. في فرنسا ، في أفضل الحالات ، يصل التجوّل التشخيصي للأمراض النادرة إلى 4 سنوات قبل أن تبدأ الرعاية الخطيرة في إطار مركز مرجعي أو مركز اختصاص. لكن تبقى بعض الأمراض دون تشخيص ... لأنها لم توصف بعد ولا يوجد مركز مرجعي.

تم إنشاء شبكة لشبكات الأمراض غير المشخصة (UDN) قبل بضع سنوات في الولايات المتحدة بواسطة الوكالة الوطنية للصحة الأمريكية (NIH) لتلبية احتياجات الأشخاص المصابين بالأمراض غير مشخصة ، معروفة أو غير معروفة.

منظمة ناجحة

UDN هي شبكة مكونة من 12 قسمًا للمستشفى ومركزين لتسلسل الجينات ومركز تنسيق ، مرتبط بمركز تخزين العينات (Biobank) ومركز تحليل التسلسل الجيني ومركز لتحليل metabolome. يرافق هذا الهيكل بأكمله بوابة إلكترونية لتعزيز التعاون مع المرضى والأطباء. الهدف من شبكة UDN هذه هو زيادة وصول المرضى إلى الخبرة متعددة التخصصات والاستفادة ، من أجل تشخيص مرضهم ، من المزايا المحددة للشبكة التعاونية ، مثل الخبرة المتخصصة الفرعية. يتم تقديم التقييم التشخيصي مجانًا للمرضى. حتى الآن ، تقدم أكثر من 3000 شخص بطلب ، وتم قبول أكثر من 1200 شخص في العملية ، وتم تقييم ما يقرب من 1000 شخص وتم تشخيص 260 شخصًا. تم نشر تقييم لأداء شبكة UDN ومتابعة المرضى في مجلة New England Journal of Medicine.

تقدم مستمر

منذ نشر تقرير UDN الأولي في عام 2012 ، انخفضت تكلفة تسلسل الجينوم البشري بشكل كبير وتحسنت أيضًا خوارزميات تحليل هذه البيانات الجينية. في العديد من المراكز الطبية الأكاديمية في الولايات المتحدة ، أصبح تسلسل الجينوم الآن روتينيًا في استكشاف المرضى الذين يعانون من أمراض وراثية نادرة ، أو يُفترض أنهم كذلك.

ومع ذلك ، فإن العديد من المرضى الذين لديهم تسلسل الجينوم يظلون في النهاية غير مشخصين ، وحتى في الأشخاص الذين لديهم تشخيص محتمل ، وبيانات تأكيد سريرية من التشخيص الجزيئي ، وتأثير هذا التشخيص على الرعاية الطبية والاستغلال هذه النتائج لفهم المرض محدودة. غالبًا لا تتوفر للمختبرات المشاركة في هذه التسلسلات إمكانية الوصول إلى معلومات المراقبة. تهدف شبكة UDN أيضًا إلى الاستجابة لهذا القصور وتريد الاعتماد على التعاون بين المراكز والجمهور للرد عليه.

تشخيص في 35 ٪ من الحالات

يتعلق التقييم المقدم في هذه المقالة بالأشخاص دون تشخيص الموجودين على UDN خلال فترة 20 شهرًا (حتى مايو 2017). كان يجب تشخيص هؤلاء الأشخاص بمرض غير مشخص على الرغم من التحقيقات الشاملة التي أجراها طبيب متخصص.

أحيل ما مجموعه 1519 مريضا (53 ٪ من النساء) إلى UDN ، تم قبول 601 (40 ٪) منهم للتقييم. من بين أولئك المقبولين ، فإن 192 (32٪) لديهم بالفعل تسلسل exome (جزء من ترميز الحمض النووي للبروتينات).

كانت الأعراض التي تم الشكوى منها عصبية في 40 ٪ من الحالات ، والعضلات والعظام في 10 ٪ من الحالات ، والمناعية في 7 ٪ من الحالات ، الجهاز الهضمي في 7 ٪ من الحالات والروماتيزم في 6 ٪ من الحالات.

من بين 382 مريضًا تلقوا تقييماً كاملاً من قبل شبكة UDN (التسلسل الجيني + التسلسلي الوراثي) ، كان 132 مريضاً لديهم تشخيص ، مما يعطي معدل تشخيص يبلغ 35٪. لكن يجب أن نتذكر أنه تم إجراء 15 تشخيصًا فقط (11٪) على التحليل الوحيد للملف بينما تم الحصول على 98 (74٪) من خلال تسلسل exome أو الجينوم الكامل.

من بين التشخيصات ، نتج 21٪ توصيات بشأن تغييرات العلاج ، و 37٪ لإجراء تغييرات على الاختبارات التشخيصية ، و 36٪ للحصول على استشارات وراثية محددة. أخيرًا ، أتاحت الشبكة تحديد 31 متلازمة جديدة ، لم تكن معروفة حتى ذلك الحين.

التسلسل الجيني هو المفتاح

هذه النتائج مثيرة لأنهم مرضى يعانون منذ سنوات ، وقد تم استكشافهم واستكشافهم بواسطة العديد من المتخصصين.

عند تحليل نتائج شبكة UDN ، فإن الدرس الأول هو أنه بالنسبة لهؤلاء المرضى الذين يعانون من صعوبات شديدة ، فإن الأطباء المتخصصين في الأطباء لن يصنعوا سوى 10٪ فقط من التشخيص وأن التسلسل الجيني هو الذي سيسمح بنسبة 90٪ من التشخيصات. يركز تسلسل الإنتاجية العالية وتحليل exome على أجزاء الترميز للجينوم البشري. أنها توفر معلومات حول الاختلافات في الجينات 20،000 المدرجة حتى الآن في الجينوم. على الرغم من أن exome لا يمثل سوى 1.5٪ من الجينوم ، إلا أنه يحتوي على 85٪ من الطفرات المسؤولة عن الأمراض الوراثية.

تم تجهيز فرنسا بمراكز تسلسل الجينات عالية الإنتاجية بفضل خطة الطب الجيني France 2025 ، التي تم إطلاقها في عام 2016 ، ولكن من الضروري أيضًا استخدام خوارزميات قوية لتمكين التشخيص. في الواقع ، في دراسة NEJM ، تؤدي هذه التشخيصات في الواقع إلى تغييرات كبيرة في العلاج ، وإلى الاستشارة الوراثية وتحسين الاختبارات التشخيصية للمرضى الآخرين الذين يعانون من المرض نفسه.

لا يزال هناك العديد من الأمراض لاكتشافها

الدرس الثاني هو أنه لا يزال هناك 65 ٪ من المرضى الذين لم يتم تشخيصهم بعد بعد هذه الإجراءات عالية الأداء للغاية. على الرغم من أن الشبكة قد وصفت 31 متلازمة غير معروفة جديدة حتى الآن ، لا يزال هناك الكثير من العمل الذي يتعين القيام به. إذا أراد المرء وصف المتلازمات غير المعروفة الأخرى من أجل اقتراح العلاج في اليوم ، فمن الواضح أنه من الضروري الاستمرار في الشبكة وتضخيمها.

لقد أنشأنا منصات تسلسل الجينات عالية السرعة في فرنسا ، وشبكة من المراكز المرجعية للأمراض النادرة ، المدمجة في إطار أوروبي. لكن بالنسبة للأمراض دون تشخيص ، تظل المشكلة صعبة حتى لو كانت هناك روابط مختلفة.

تعاون دولي ضروري

إذا كان هناك شيء واحد يكون فيه الأمريكيون أقوياء للغاية ، فهو المنظمة. ربما سيكون من الممكن ، بموجب خطة الأمراض النادرة التالية ، بناء جسور مع شبكة UDN الأمريكية لجعلها شبكة دولية للأمراض غير المشخصة. هناك الكثير من العمل وتجميع الوسائل والبيانات من شأنه أن يسمح لنا بالمرور بشكل أسرع لتشخيص هؤلاء 65 ٪ من المرضى دون تشخيص.

هذا أمر بالغ الأهمية لأن تقنيات إصلاح الجينوم (كريسبر Cas9) أو عرقلة الجينات غير الطبيعية (antisense) تصل واستخدامها في السريرية الإنسان ربما ليست بعيدة جدا.

فيديو: الارقام السحرية ارقام الحظ من1 الي9 سيذهلك ماتشاهدة في هذا الفيديو (شهر نوفمبر 2019).